在1949年1月，王冠亚加入了中国人民解放军，并在阜阳军分区文工队、安徽军区文工团和南京军区前线歌舞团中担任文艺工作。1956年5月，他转业至安徽省黄梅戏剧团，担任表演者、导演、编剧以及创作组的副组长，同时还曾是二团艺委会主任。在1989年11月，他荣获退休。王冠亚的学术背景包括1950年的安徽师范大学数学系本科毕业，以及1965年的上海戏剧学院戏曲导演干部进修班结业。
他曾经成功地执导了多部黄梅戏舞台剧，如《红楼梦》、《西厢记》等。此后，又创作改编了17部70集电视连续剧，其中包括《西厢记》、《貂蝉》、《桃花扇》，这些作品多次获得大众电视“金鹰奖”、“飞天奖”，以及美国南海金猴奖。他还专注于黄梅戏的发展，创作并导演了舞台剧《孟姜女》，并且参与制作电影版的《孟姜女》，此外，还参加了新加坡第二届中国电影节。