在1989年1月21日，亨里克•姆希塔良(Henrikh Mkhitaryan)出生于亚美尼亚的首都埃里温。他的父亲哈姆莱特•姆希塔良因瓦朗斯俱乐部的邀约不久后带他离开了家乡前往法国。哈姆莱特是一名前锋，在球队中以进球累累著称，深受国内球迷尊重。在14岁时，姆希塔良曾在巴西圣保罗俱乐部试训三个月，并最终加盟了法国低级别联赛球队法朗斯梯队。
然而，天意弄人，姆希塔良的父亲因为脑部肿瘤突然去世，这让他不得不回到家乡和母亲一起生活。在2005年，他加盟了国内最大的俱乐部埃里温凤凰，从此开始了他的足球职业生涯。
在效力于埃里温凤凰四个赛季期间（2005-2009），姆希塔良共出场89次并打进35个进球，同时帮助球队赢得四次亚美尼亚足球超级联赛冠军、两次亚美尼亚超级杯冠军以及一次亚美尼亚杯冠军。他在家乡联赛中的表现证明了他的足球天赋，而后转会到乌克兰联赛后，他依然保持着完美的表现。
2009年，加盟顿涅茨克冶金之后，在首个赛季就攻入14个进球震惊乌克兰足协。但作为冶金队历史上最年轻的队长，在仅仅一个赛季后，他以540万英镑的价格加盟同样是乌克兰联赛的顿涅茨克矿工足球俱乐部。在矿工一支团队下，他赢得了一系列荣誉，如三冠王（乌克兰联赛、乌克兰杯和超级杯）。
2011-12赛季，他再次赢得双料冠军，并被选为最佳运动员。而2012-13赛季，25粒进球使他成为乌克兰联賽最佳射手，也获得了“金靴”奖项。
由于在矿工所展现出的卓越能力，使得他成为了全世界范围内足球界关注焦点。在前场速度优势显著，让他从11岁起就频繁出现在全球媒体报道中，最早有意引援他的豪门之一是阿森纳，但双方没有进行深入交流。同时也成为了多特蒙德与利物浦竞争目标，因为这两支强劲对手放弃了自己的攻击核心格策与苏亚雷斯。