在1949年1月，王冠亚加入了中国人民解放军，并在阜阳军分区文工队、安徽军区文工团以及南京军区前线歌舞团中从事了文艺工作。1956年5月，他转业到安徽省黄梅戏剧团担任表演者、导演、编剧和创作组的副组长，同时还曾担任过二团艺委会主任等职务。在1989年11月，他退休。他的学术背景是1940年代末毕业于安徽师范大学数学系本科，并且1965年在上海戏剧学院完成了戏曲导演干部进修班的学习。
王冠亚曾经执导过多部黄梅戏舞台剧，如《红楼梦》、《西厢记》等。此后他又专注于改编电视连续剧，共计创作并改编了17部70集电视连续剧，其中包括《西厢记》、《貂蝉》、《桃花扇》，这些作品获得了大众电视“金鹰奖”、“飞天奖”以及美国南海金猴奖的殊荣。他还独特地将黄梅戲元素融入电影中，以电影《孟姜女》为例，这部作品参加了新加坡第二届中国电影节。