在中国历史的长河中，内阁和军机处是两大重要机构，它们分别在明朝和清朝扮演着关键角色。然而，尽管它们在功能上有所不同，但它们之间存在着深刻的联系和相似的职责。
明朝时期，翰林院作为皇帝的顾问和秘书，从唐高宗时期便已经存在。朱棣入主中都后，便将翰林院的一部分人引入文渊阁，以参与政务，这标志着内阁制度的诞生。明代内阁与宰相不同，它既不统驭六部，又受制于内监。这一点，在学者张飞燕《明朝的内阁和清朝的军机处》一文中得到了详细论述。
最初，文渊阁只是翰林院的一个分支机构，但随着时间推移，它独立批答奏章，并且办公地点由御前转移到了文渊阁。这意味着从临时性设施到永久性机构转变，同时也反映了内阁由皇帝侍从幕僚到中枢机关的地位提升。但这同时也为宦官擅权创造了条件。
清朝入关后恢复了明代的内阁制度，这是一个拥有288人正规编制的大型辅政机关。但它只负责办理一般事务，而重大和机密的事务则由议政王大臣会议办理。在康熙新政之后，由于皇帝直接处理各项政务，因此需要一个处理机要秘书的事务机构，即军机处。
雍正年间建立的地方是隆宗门中的军需房，专门进行重大的机密事务。而这一切都是为了确保皇权不旁落，也是杜绝宦官专权的一个措施。然而这种决策体系虽然能维持稳定，却无法应对全球工业化带来的挑战。
“同治中兴”期间，由曾国藩、左宗棠等汉族知识分子参与决策。此后康有为、梁启超、袁世凯虽试图影响最高决策，但最终还是慈禧太后和皇族内部的人才决定一切重大事情。而当他们想通的时候，那些机会往往已经错过了。
总结来说，无论是在结构还是职责上，明代內閣與清代軍機處都有著共同之處，以及其間彼此交替使用不同的職權範圍。在這個過程中，不僅展現出中國古代政治體系如何適應時代變遷，更是一幅宏大的歷史畫卷，每一個細節都值得我們去探索與思考。
