在1949年1月，王冠亚加入了中国人民解放军，并在阜阳军分区文工队、安徽军区文工团和南京军区前线歌舞团担任文艺工作。1956年5月，他转业至安徽省黄梅戏剧团，在那里他担任表演、导演、编剧和创作组副组长，以及二团艺委会主任等职务，直到1989年11月离休。在学术领域，他于1950年毕业于安徽师范大学（原国立安徽大学）的数学系，并在1965年结业于上海戏剧学院的戏曲导演干部进修班。
王冠亚曾经以其卓越的才华指导了多部黄梅戏舞台剧，如《红楼梦》、《西厢记》，并且为这些作品增添了新的生命力。此后，他又创作改编了17部70集电视连续剧，如《西厢记》、《貂蝉》、《桃花扇》，并因此获得了一系列荣誉，包括大众电视“金鹰奖”、“飞天奖”以及美国南海金猴奖。他不仅如此，还创作并导演了一些黄梅戏舞台剧，比如《孟姜女》，并且还参与制作了一部电影版的《孟姜女》，并且出席了新加坡第二届中国电影节。